Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TMIEQ8NEW7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TMIEQ8NEW7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TMIEQ8NEW7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TMIEQ8NEW7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TMIEQ8NEW7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TMIEQ8NEW7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TMIEQ8NEW7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TMIEQ8NEW7 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TMIEQ8NEW7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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TMIEQ8NEW7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMIEQ8NEW7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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