Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ATG4DQ86TL0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ATG4DQ86TL0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ATG4DQ86TL0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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ATG4DQ86TL0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ATG4DQ86TL0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ATG4DQ86TL0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ATG4DQ86TL0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ATG4DQ86TL0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ATG4DQ86TL0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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