Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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LINC00299Q6ZSB3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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LINC00299Q6ZSB3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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LINC00299Q6ZSB3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00299Q6ZSB3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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LINC00299Q6ZSB3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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LINC00299Q6ZSB3 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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LINC00299Q6ZSB3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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LINC00299Q6ZSB3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00299Q6ZSB3 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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