Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms