Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms