Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZBED5Q49AG3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ZBED5Q49AG3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms