Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q499Y3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q499Y3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q499Y3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q499Y3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q499Y3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q499Y3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q499Y3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q499Y3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q499Y3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q499Y3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q499Y3 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q499Y3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q499Y3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q499Y3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q499Y3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q499Y3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q499Y3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q499Y3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q499Y3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q499Y3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q499Y3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q499Y3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q499Y3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q499Y3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q499Y3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q499Y3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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