Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 AL592528.1-201ENST00000380008 3466 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 RTN3-203ENST00000341307 2524 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 NCDN-202ENST00000373243 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM8B-201ENST00000377988 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 NHSL2-202ENST00000510661 3082 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 LGALS8-208ENST00000416919 6097 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP25-1Q3LHN0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms