Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

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Length 1,214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NBPF1Q3BBV0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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