Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL40Q2TBA0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms