Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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RTL8BQ17RB0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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RTL8BQ17RB0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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RTL8BQ17RB0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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RTL8BQ17RB0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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RTL8BQ17RB0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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RTL8BQ17RB0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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RTL8BQ17RB0 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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RTL8BQ17RB0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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RTL8BQ17RB0 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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