Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms