Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NCAPHQ15003 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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