Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNAB1Q14722 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.9 ms