Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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SHROOM2Q13796 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHROOM2Q13796 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
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