Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FHL3Q13643 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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