Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CUL3Q13618 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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