Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms