Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms