Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM3AP98173 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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FAM3AP98173 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FAM3AP98173 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FAM3AP98173 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FAM3AP98173 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FAM3AP98173 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FAM3AP98173 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FAM3AP98173 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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FAM3AP98173 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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FAM3AP98173 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3AP98173 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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