Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
STX17P56962 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
STX17P56962 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STX17P56962 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STX17P56962 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STX17P56962 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STX17P56962 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
STX17P56962 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STX17P56962 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STX17P56962 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STX17P56962 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STX17P56962 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
STX17P56962 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
STX17P56962 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
STX17P56962 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
STX17P56962 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms