Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPOLAP51003 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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