Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCLMP48507 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCLMP48507 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCLMP48507 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCLMP48507 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCLMP48507 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCLMP48507 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCLMP48507 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCLMP48507 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCLMP48507 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GCLMP48507 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCLMP48507 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms