Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MDH1P40925 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MDH1P40925 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MDH1P40925 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MDH1P40925 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MDH1P40925 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MDH1P40925 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MDH1P40925 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MDH1P40925 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MDH1P40925 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MDH1P40925 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MDH1P40925 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MDH1P40925 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MDH1P40925 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MDH1P40925 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MDH1P40925 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MDH1P40925 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MDH1P40925 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MDH1P40925 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms