Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR1AP35321 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms