Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHMLP26374 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHMLP26374 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHMLP26374 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHMLP26374 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms