Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ITGA3P26006 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms