Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEFLP07196 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEFLP07196 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEFLP07196 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEFLP07196 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEFLP07196 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEFLP07196 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEFLP07196 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEFLP07196 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEFLP07196 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEFLP07196 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEFLP07196 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEFLP07196 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEFLP07196 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEFLP07196 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEFLP07196 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms