Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KDM4BO94953 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KDM4BO94953 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KDM4BO94953 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KDM4BO94953 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KDM4BO94953 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KDM4BO94953 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KDM4BO94953 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KDM4BO94953 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KDM4BO94953 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KDM4BO94953 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KDM4BO94953 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KDM4BO94953 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KDM4BO94953 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KDM4BO94953 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KDM4BO94953 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KDM4BO94953 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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KDM4BO94953 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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KDM4BO94953 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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KDM4BO94953 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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KDM4BO94953 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KDM4BO94953 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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