Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGSM2O43147 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGSM2O43147 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGSM2O43147 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms