Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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C4orf47A7E2U8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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C4orf47A7E2U8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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C4orf47A7E2U8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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C4orf47A7E2U8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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C4orf47A7E2U8 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf47A7E2U8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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