Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SLC12A4Q9UP95 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms