Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5BQ9UGL1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms