Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYLDQ9NQC7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms