Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

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Length 718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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