Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM55Q9BYV6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms