Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP8Q99708 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms