Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SGF29Q96ES7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SGF29Q96ES7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SGF29Q96ES7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SGF29Q96ES7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SGF29Q96ES7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SGF29Q96ES7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SGF29Q96ES7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGF29Q96ES7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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