Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SIRT1Q96EB6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SIRT1Q96EB6 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms