Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms