Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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HDAC10Q969S8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC10Q969S8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC10Q969S8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC10Q969S8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC10Q969S8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC10Q969S8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC10Q969S8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC10Q969S8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC10Q969S8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC10Q969S8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC10Q969S8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC10Q969S8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC10Q969S8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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