Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
UBXN4Q92575 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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