Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM71DQ8N9W8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms