Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKL3Q8IVW4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms