Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms