Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
USF2Q15853 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms