Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.8 ms