Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKIV2LQ15477 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKIV2LQ15477 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms