Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAPVD1Q14C86 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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