Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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